A Prefeitura Universitária conta com as seguintes áreas:
- Divisão de Água e Energia
- Divisão de Alimentação
- Divisão de Manutenção
- Divisão de Meio Ambiente
- Divisão de Transporte e Trânsito (Unitransp)
- Diretoria de Pontos Comerciais
As áreas de apoio são constituídas pelas seguintes diretorias: